車輛合格證是交給車管所保存的。在上牌過程中，車管所會將車輛合格證放入車輛信息的檔案袋中儲存，因此，車輛合格證在上牌后不會返回給車主。

車輛合格證是汽車上牌的重要證件之一，它用于證明車輛的各項指數符合國家法規(guī)標準。雖然車輛合格證會與車主個人資料、保單、購車發(fā)票等信息一起儲存在車管所，但車管所通常不會對車主進行詳細解釋，這也是車主產生擔憂的原因。實際上，包括車輛合格證在內的檔案，通常只有在車輛轉讓、過戶或外遷時才會使用到，因此車主不必過于擔心。

除了證明車輛指數符合規(guī)定外，車輛合格證還可以作為貸款購車的抵押。如果車主選擇貸款購車的方式，那么車輛合格證可能會抵押在貸款公司手中，而不是在車主手中。