C1駕照被扣12分后的處理流程如下：

1、根據(jù)《機動車駕駛證申領(lǐng)和使用規(guī)定》的相關(guān)規(guī)定，一旦駕駛?cè)嗽谝粋€記分周期內(nèi)累積記分達到12分，公安機關(guān)交通管理部門將扣留其機動車駕駛證。

2、駕駛?cè)吮仨氃谑迦諆?nèi)到機動車駕駛證核發(fā)地或違法行為地的公安機關(guān)交通管理部門參加為期七日的道路交通安全法律、法規(guī)和相關(guān)知識學(xué)習(xí)。

3、參加完學(xué)習(xí)后，駕駛?cè)诵柙诙諆?nèi)參加道路交通安全法律、法規(guī)和相關(guān)知識考試?？荚嚭细窈?，記分將被清除并發(fā)還機動車駕駛證。若考試不合格，則需繼續(xù)參加學(xué)習(xí)和考試。對于拒不參加學(xué)習(xí)也不接受考試的駕駛?cè)耍矙C關(guān)交通管理部門將公告其機動車駕駛證停止使用。