違反公司員工購車補貼協(xié)議可能會有以下后果。

首先，如果像案例中的黃某某未按協(xié)議繼續(xù)為公司工作，屬于不完全履行合同，公司可要求其返還未履行服務期應分攤的購車補助款。比如黃某某承諾工作 10 年，實際工作 68 個月，尚有 52 個月未履行，就要退還相應購車補貼款 35534 元。

其次，如果是 4S 店員工離職導致不兌現(xiàn)購車返利承諾，4S 店被判擔責，因為銷售承諾行為屬公司職務行為，承諾應予兌付。

再次，如果違反員工購車管理暫行規(guī)定，比如無照駕駛、未經(jīng)許可借車給他人、酒后或吸毒后駕車發(fā)生事故、利用所購車輛從事其他商業(yè)運營、利用所購車款從事違法活動等，除扣除已補助的補助金外，還會按補助金總額的 30%予以處罰。給公司造成損失的，要承擔一切經(jīng)濟損失，構成犯罪的依法追究刑事責任。

另外，如果像黃女士這樣因個人原因提前離職，違反雙方特殊約定，公司可能認為其應支付違約金并返還購車補貼。但根據(jù)相關法律規(guī)定，用人單位與勞動者就違約行為約定違約金僅限于勞動者違反用人單位提供專項培訓的服務期協(xié)議和違反競業(yè)限制協(xié)議這兩種情形。

所以，遇到違反公司員工購車補貼協(xié)議的情況，先與單位協(xié)商，補簽勞動合同或者自己離職并要求公司支付相應補償金。協(xié)商不成，再向勞動監(jiān)察大隊投訴。還不行，就直接向勞動爭議仲裁委員會申請仲裁或者向法院提起訴訟，勞動仲裁的處理通常比訴訟快一些。